Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP1Q9UPQ3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP1Q9UPQ3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms