Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FZD1Q9UP38 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FZD1Q9UP38 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FZD1Q9UP38 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FZD1Q9UP38 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FZD1Q9UP38 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FZD1Q9UP38 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms