Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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USP18Q9UMW8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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USP18Q9UMW8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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USP18Q9UMW8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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USP18Q9UMW8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
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USP18Q9UMW8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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USP18Q9UMW8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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