Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMFRQ9UKV5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms