Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms