Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms