Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPS7AQ9UBW8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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