Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF1Q9UBU9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms