Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms