Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGA3Q9NZ52 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms