Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK12Q9NYV4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms