Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms