Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNK4Q9NYG8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms