Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms