Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms