Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRAC1Q9NRG0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRAC1Q9NRG0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms