Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 CDK19-206ENST00000463016 604 ntTSL 55.92□□□□□ -1.462e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TTN-AS1-241ENST00000591332 528 ntTSL 55.91□□□□□ -1.465e-7■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.472e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CDK8-204ENST00000480323 1996 ntTSL 25.84□□□□□ -1.472e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.482e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.482e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PPFIBP1-208ENST00000538433 609 ntTSL 35.82□□□□□ -1.482e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 POR-214ENST00000449920 283 ntTSL 55.76□□□□□ -1.492e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 WWOX-208ENST00000562639 595 ntTSL 45.73□□□□□ -1.492e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 MTERF4-206ENST00000414146 457 ntTSL 55.64□□□□□ -1.512e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.512e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TMEM68-203ENST00000517576 751 ntTSL 55.51□□□□□ -1.532e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 RBBP8-215ENST00000583700 564 ntTSL 45.51□□□□□ -1.532e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TOR1AIP1-211ENST00000531726 475 ntTSL 35.51□□□□□ -1.532e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.46□□□□□ -1.542e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 HECTD1-217ENST00000557369 554 ntTSL 45.45□□□□□ -1.542e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.542e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.552e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PPP2R1B-208ENST00000530787 131 ntTSL 1 (best)5.21□□□□□ -1.582e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 C15orf41-209ENST00000566677 5843 ntTSL 25.09□□□□□ -1.62e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TMOD3-205ENST00000558714 534 ntTSL 35.08□□□□□ -1.62e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.622e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.632e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 HECTD1-204ENST00000553957 4395 ntTSL 24.8□□□□□ -1.642e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.652e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.674e-8■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC4.47□□□□□ -1.692e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CAND1-204ENST00000540319 2786 ntTSL 24□□□□□ -1.772e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.782e-6■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BDP1-206ENST00000525844 4997 ntTSL 1 (best)2.49□□□□□ -2.019e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 HOXC10-205ENST00000515593 526 ntTSL 48.51□□□□□ -1.058e-8■■■■■ 223.3
UTP3Q9NQZ2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.12e-6■■■■■ 222.6
UTP3Q9NQZ2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.062e-6■■■■■ 222.6
UTP3Q9NQZ2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 222.6
UTP3Q9NQZ2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.931e-6■■■■■ 222.6
UTP3Q9NQZ2 RHEB-205ENST00000478470 1153 ntTSL 526.58■■□□□ 1.851e-6■■■■■ 222.6
UTP3Q9NQZ2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.061e-6■■■■■ 222.6
UTP3Q9NQZ2 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 222.6
UTP3Q9NQZ2 AKT2-239ENST00000583859 567 ntTSL 527.29■■□□□ 1.965e-7■■■■■ 222.1
UTP3Q9NQZ2 AKT2-214ENST00000456441 582 ntTSL 322.63■■□□□ 1.215e-7■■■■■ 222.1
UTP3Q9NQZ2 AKT2-213ENST00000452077 577 ntTSL 312.6□□□□□ -0.395e-7■■■■■ 222.1
UTP3Q9NQZ2 AKT2-229ENST00000578123 564 ntTSL 411.43□□□□□ -0.585e-7■■■■■ 222.1
UTP3Q9NQZ2 AKT2-202ENST00000358335 546 ntTSL 410.51□□□□□ -0.735e-7■■■■■ 222.1
UTP3Q9NQZ2 AKT2-241ENST00000596634 583 ntTSL 510.21□□□□□ -0.775e-7■■■■■ 222.1
UTP3Q9NQZ2 USP7-214ENST00000566224 503 ntTSL 312.09□□□□□ -0.478e-7■■■■■ 222.1
UTP3Q9NQZ2 USP7-212ENST00000566004 559 ntTSL 47.58□□□□□ -1.28e-7■■■■■ 222.1
UTP3Q9NQZ2 USP7-209ENST00000564117 479 ntTSL 45.93□□□□□ -1.468e-7■■■■■ 222.1
UTP3Q9NQZ2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.192e-7■■■■■ 222
UTP3Q9NQZ2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.092e-7■■■■■ 222
UTP3Q9NQZ2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.882e-7■■■■■ 222
UTP3Q9NQZ2 LRCH4-202ENST00000467201 4754 ntTSL 217.99■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 222
UTP3Q9NQZ2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.852e-7■■■■■ 222
UTP3Q9NQZ2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.881e-10■■■■■ 221.9
UTP3Q9NQZ2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.571e-10■■■■■ 221.9
UTP3Q9NQZ2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.441e-10■■■■■ 221.9
UTP3Q9NQZ2 ARL6IP4-216ENST00000539770 1295 ntTSL 1 (best)23.74■■□□□ 1.391e-10■■■■■ 221.9
UTP3Q9NQZ2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.21e-10■■■■■ 221.9
UTP3Q9NQZ2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.191e-10■■■■■ 221.9
UTP3Q9NQZ2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.221e-10■■■■■ 221.9
UTP3Q9NQZ2 FKBP8-204ENST00000596015 612 ntTSL 318.07■□□□□ 0.485e-8■■■■■ 221.7
UTP3Q9NQZ2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.334e-7■■■■■ 221.7
UTP3Q9NQZ2 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.365e-22■■■■■ 221.5
UTP3Q9NQZ2 RHPN1-202ENST00000522335 3656 ntTSL 1 (best)15.37■□□□□ 0.055e-22■■■■■ 221.5
UTP3Q9NQZ2 JUP-212ENST00000591690 583 ntTSL 319.84■□□□□ 0.779e-8■■■■■ 221.2
UTP3Q9NQZ2 JUP-208ENST00000449889 1069 ntTSL 318.26■□□□□ 0.519e-8■■■■■ 221.2
UTP3Q9NQZ2 JUP-205ENST00000424457 949 ntTSL 316.29■□□□□ 0.29e-8■■■■■ 221.2
UTP3Q9NQZ2 JUP-206ENST00000437187 1029 ntTSL 316.29■□□□□ 0.29e-8■■■■■ 221.2
UTP3Q9NQZ2 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.185e-13■■■■■ 221.1
UTP3Q9NQZ2 PACSIN1-201ENST00000244458 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.295e-13■■■■■ 221.1
UTP3Q9NQZ2 PACSIN1-202ENST00000374043 4229 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.295e-13■■■■■ 221.1
UTP3Q9NQZ2 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC12.51□□□□□ -0.413e-17■■■■■ 221.1
UTP3Q9NQZ2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 221
UTP3Q9NQZ2 DCAF8-209ENST00000466253 1078 ntTSL 510.51□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 221
UTP3Q9NQZ2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.361e-8■■■■■ 220.9
UTP3Q9NQZ2 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 220.9
UTP3Q9NQZ2 SS18-204ENST00000539244 977 ntTSL 1 (best)14.32□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 220.9
UTP3Q9NQZ2 SS18-202ENST00000269138 1548 ntTSL 213.74□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 220.9
UTP3Q9NQZ2 SS18-225ENST00000585121 1545 ntTSL 213.15□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 220.9
UTP3Q9NQZ2 SS18-213ENST00000579640 1840 ntTSL 211.51□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 220.9
UTP3Q9NQZ2 SS18-203ENST00000415083 3414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.72e-7■■■■■ 220.9
UTP3Q9NQZ2 SS18-205ENST00000542420 2321 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.742e-7■■■■■ 220.9
UTP3Q9NQZ2 CCDC57-204ENST00000392345 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.89□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 220.9
UTP3Q9NQZ2 CCDC57-205ENST00000392346 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.343e-6■■■■■ 220.9
UTP3Q9NQZ2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.169e-7■■■■■ 220.8
UTP3Q9NQZ2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.979e-7■■■■■ 220.8
UTP3Q9NQZ2 HNRNPM-215ENST00000601645 832 ntTSL 315.09■□□□□ 0.018e-7■■■■■ 220.7
UTP3Q9NQZ2 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 220.7
UTP3Q9NQZ2 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 220.7
UTP3Q9NQZ2 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 220.7
UTP3Q9NQZ2 MIDN-205ENST00000591302 523 ntTSL 220.22■□□□□ 0.838e-10■■■■■ 220.5
UTP3Q9NQZ2 TUBGCP6-207ENST00000491449 4044 ntTSL 513.42□□□□□ -0.268e-10■■■■■ 220.5
UTP3Q9NQZ2 NDUFS7-213ENST00000543289 3356 ntTSL 220.35■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 220
UTP3Q9NQZ2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 220
UTP3Q9NQZ2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 220
UTP3Q9NQZ2 NDUFS7-215ENST00000546172 869 ntTSL 518.69■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 220
UTP3Q9NQZ2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 220
UTP3Q9NQZ2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 220
UTP3Q9NQZ2 NDUFS7-205ENST00000534853 745 ntTSL 516.08■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 220
UTP3Q9NQZ2 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 220
UTP3Q9NQZ2 NDUFS7-214ENST00000545446 3089 ntTSL 214.74□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 220
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