Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms