Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms