Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRDE2Q9H7Z3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRDE2Q9H7Z3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms