Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms