Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms