Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms