Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms