Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms