Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms