Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms