Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4K2AQ9BTU6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PI4K2AQ9BTU6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms