Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms