Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SGIP1Q9BQI5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms