Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN18Q99952 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN18Q99952 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms