Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms