Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK5RAP2Q96SN8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms