Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CR12Q96Q35 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms