Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCLT1Q96NL6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms