Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20AQ96MK3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms