Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms