Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms