Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms