Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG1Q96JA1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms