Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CELF6Q96J87 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms