Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF496Q96IT1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF496Q96IT1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms