Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms