Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
LIN37Q96GY3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LIN37Q96GY3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LIN37Q96GY3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LIN37Q96GY3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIN37Q96GY3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIN37Q96GY3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIN37Q96GY3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIN37Q96GY3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIN37Q96GY3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIN37Q96GY3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIN37Q96GY3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LIN37Q96GY3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms