Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR4

ZDHHC12, Probable palmitoyltransferase ZDHHC12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC12Q96GR4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZDHHC12Q96GR4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms