Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJA3Q96EY1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJA3Q96EY1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJA3Q96EY1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJA3Q96EY1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJA3Q96EY1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJA3Q96EY1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJA3Q96EY1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJA3Q96EY1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJA3Q96EY1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJA3Q96EY1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms