Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FBXO17Q96EF6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms