Protein–RNA interactions for Protein: Q96B42

TMEM18, Transmembrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM18Q96B42 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM18Q96B42 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms