Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
TNPO1Q92973 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms