Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF4BQ92750 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF4BQ92750 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF4BQ92750 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF4BQ92750 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF4BQ92750 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF4BQ92750 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF4BQ92750 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF4BQ92750 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF4BQ92750 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF4BQ92750 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF4BQ92750 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF4BQ92750 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF4BQ92750 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF4BQ92750 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms